Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms