Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms