Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms