Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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