Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PDK4Q16654 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PDK4Q16654 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK4Q16654 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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