Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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SGCAQ16586 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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