Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL23Q16540 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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