Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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