Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS72Q15906 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
VPS72Q15906 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS72Q15906 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS72Q15906 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS72Q15906 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS72Q15906 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS72Q15906 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS72Q15906 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS72Q15906 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms