Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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