Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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