Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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