Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPAQ15257 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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