Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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