Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PDK3Q15120 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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