Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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