Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms