Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCAPD2Q15021 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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