Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLCA4Q14CN2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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