Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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