Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCD11Q14690 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD11Q14690 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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