Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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