Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GBX1Q14549 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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