Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3AQ14152 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3AQ14152 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms