Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBFBQ13951 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CBFBQ13951 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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