Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCINQ13939 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCINQ13939 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCINQ13939 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCINQ13939 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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