Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC2Q13868 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms