Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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