Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FHL3Q13643 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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