Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL4AQ13619 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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