Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRQ13535 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRQ13535 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRQ13535 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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