Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BFSP2Q13515 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BFSP2Q13515 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms