Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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MTM1Q13496 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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MTM1Q13496 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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MTM1Q13496 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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MTM1Q13496 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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MTM1Q13496 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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MTM1Q13496 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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