Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF1Q13351 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms