Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SKP2Q13309 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SKP2Q13309 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKP2Q13309 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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