Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
GRIN2BQ13224 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms