Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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