Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAF1AQ13111 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAF1AQ13111 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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