Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECH1Q13011 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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