Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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