Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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