Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ST3GAL4Q11206 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ST3GAL4Q11206 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ST3GAL4Q11206 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ST3GAL4Q11206 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ST3GAL4Q11206 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ST3GAL4Q11206 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms