Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms