Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms