Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms