Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms