Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4DQ08499 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms