Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms