Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN1BQ07699 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms