Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBQ06643 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms